Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms