Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00518Q8N0U6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00518Q8N0U6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms