Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAP2Q8IXW5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAP2Q8IXW5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms