Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCBE1Q6UXH8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCBE1Q6UXH8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms