Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF6Q6KF10 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDF6Q6KF10 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms