Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms