Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
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SEC23BQ15437 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SEC23BQ15437 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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SEC23BQ15437 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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