Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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UBE2V1Q13404 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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UBE2V1Q13404 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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UBE2V1Q13404 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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UBE2V1Q13404 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
UBE2V1Q13404 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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