Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3B2Q13367 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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