Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LRP1Q07954 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms