Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms