Protein–RNA interactions for Protein: P84103

SRSF3, Serine/arginine-rich splicing factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF3P84103 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF3P84103 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms