Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTA1P68133 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms