Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms