Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3S2P59780 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms