Protein–RNA interactions for Protein: P59046

NLRP12, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP12P59046 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NLRP12P59046 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP12P59046 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms