Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP4P49662 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP4P49662 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP4P49662 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP4P49662 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP4P49662 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP4P49662 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP4P49662 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP4P49662 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP4P49662 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP4P49662 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP4P49662 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP4P49662 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP4P49662 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP4P49662 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP4P49662 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP4P49662 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP4P49662 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP4P49662 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP4P49662 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP4P49662 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP4P49662 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP4P49662 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP4P49662 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP4P49662 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP4P49662 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP4P49662 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP4P49662 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP4P49662 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP4P49662 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP4P49662 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP4P49662 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP4P49662 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP4P49662 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP4P49662 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP4P49662 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP4P49662 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP4P49662 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP4P49662 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP4P49662 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP4P49662 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP4P49662 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP4P49662 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP4P49662 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP4P49662 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP4P49662 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP4P49662 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP4P49662 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP4P49662 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP4P49662 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP4P49662 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP4P49662 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP4P49662 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP4P49662 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP4P49662 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP4P49662 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP4P49662 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP4P49662 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP4P49662 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP4P49662 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP4P49662 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP4P49662 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP4P49662 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP4P49662 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP4P49662 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP4P49662 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP4P49662 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP4P49662 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP4P49662 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP4P49662 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP4P49662 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP4P49662 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP4P49662 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP4P49662 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP4P49662 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP4P49662 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP4P49662 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP4P49662 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP4P49662 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP4P49662 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP4P49662 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP4P49662 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASP4P49662 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASP4P49662 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASP4P49662 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASP4P49662 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASP4P49662 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASP4P49662 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASP4P49662 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP4P49662 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP4P49662 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP4P49662 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP4P49662 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP4P49662 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP4P49662 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP4P49662 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP4P49662 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP4P49662 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP4P49662 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP4P49662 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms