Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA4P43681 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA4P43681 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA4P43681 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA4P43681 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA4P43681 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA4P43681 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms