Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NR4A2P43354 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR4A2P43354 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms