Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6V1E1P36543 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms