Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FLT4P35916 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FLT4P35916 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FLT4P35916 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FLT4P35916 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FLT4P35916 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FLT4P35916 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FLT4P35916 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FLT4P35916 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FLT4P35916 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FLT4P35916 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FLT4P35916 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FLT4P35916 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FLT4P35916 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FLT4P35916 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FLT4P35916 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FLT4P35916 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FLT4P35916 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FLT4P35916 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FLT4P35916 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FLT4P35916 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FLT4P35916 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FLT4P35916 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FLT4P35916 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FLT4P35916 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FLT4P35916 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FLT4P35916 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FLT4P35916 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FLT4P35916 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FLT4P35916 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FLT4P35916 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FLT4P35916 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FLT4P35916 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FLT4P35916 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FLT4P35916 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FLT4P35916 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FLT4P35916 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
FLT4P35916 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FLT4P35916 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
FLT4P35916 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FLT4P35916 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FLT4P35916 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FLT4P35916 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FLT4P35916 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FLT4P35916 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FLT4P35916 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FLT4P35916 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FLT4P35916 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FLT4P35916 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FLT4P35916 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FLT4P35916 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FLT4P35916 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FLT4P35916 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FLT4P35916 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FLT4P35916 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FLT4P35916 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FLT4P35916 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FLT4P35916 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FLT4P35916 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
FLT4P35916 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
FLT4P35916 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
FLT4P35916 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
FLT4P35916 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
FLT4P35916 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
FLT4P35916 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
FLT4P35916 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
FLT4P35916 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
FLT4P35916 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
FLT4P35916 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
FLT4P35916 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
FLT4P35916 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FLT4P35916 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FLT4P35916 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FLT4P35916 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FLT4P35916 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FLT4P35916 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FLT4P35916 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FLT4P35916 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FLT4P35916 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FLT4P35916 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FLT4P35916 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FLT4P35916 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FLT4P35916 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FLT4P35916 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FLT4P35916 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FLT4P35916 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FLT4P35916 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FLT4P35916 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FLT4P35916 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FLT4P35916 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FLT4P35916 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FLT4P35916 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FLT4P35916 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FLT4P35916 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FLT4P35916 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FLT4P35916 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FLT4P35916 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FLT4P35916 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FLT4P35916 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FLT4P35916 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms