Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF2P35227 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms