Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPIFP30405 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPIFP30405 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PPIFP30405 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPIFP30405 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPIFP30405 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPIFP30405 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPIFP30405 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPIFP30405 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPIFP30405 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPIFP30405 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPIFP30405 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPIFP30405 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPIFP30405 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPIFP30405 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PPIFP30405 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPIFP30405 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPIFP30405 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPIFP30405 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPIFP30405 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPIFP30405 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPIFP30405 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPIFP30405 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPIFP30405 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPIFP30405 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPIFP30405 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPIFP30405 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPIFP30405 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPIFP30405 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPIFP30405 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPIFP30405 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPIFP30405 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPIFP30405 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPIFP30405 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPIFP30405 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPIFP30405 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPIFP30405 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPIFP30405 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPIFP30405 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPIFP30405 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPIFP30405 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPIFP30405 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPIFP30405 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPIFP30405 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPIFP30405 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPIFP30405 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPIFP30405 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPIFP30405 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPIFP30405 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPIFP30405 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPIFP30405 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPIFP30405 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPIFP30405 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPIFP30405 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPIFP30405 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPIFP30405 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PPIFP30405 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPIFP30405 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PPIFP30405 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPIFP30405 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPIFP30405 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPIFP30405 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPIFP30405 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPIFP30405 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPIFP30405 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPIFP30405 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPIFP30405 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms