Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSPP15924 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSPP15924 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSPP15924 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSPP15924 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSPP15924 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSPP15924 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSPP15924 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSPP15924 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DSPP15924 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSPP15924 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSPP15924 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSPP15924 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSPP15924 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSPP15924 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSPP15924 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSPP15924 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSPP15924 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSPP15924 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSPP15924 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSPP15924 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSPP15924 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSPP15924 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DSPP15924 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSPP15924 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSPP15924 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSPP15924 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSPP15924 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSPP15924 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSPP15924 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSPP15924 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSPP15924 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSPP15924 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSPP15924 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSPP15924 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSPP15924 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSPP15924 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DSPP15924 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSPP15924 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSPP15924 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSPP15924 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DSPP15924 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSPP15924 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSPP15924 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSPP15924 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSPP15924 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSPP15924 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSPP15924 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSPP15924 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSPP15924 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSPP15924 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSPP15924 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSPP15924 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSPP15924 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DSPP15924 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSPP15924 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSPP15924 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSPP15924 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSPP15924 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSPP15924 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSPP15924 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSPP15924 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSPP15924 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSPP15924 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSPP15924 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSPP15924 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSPP15924 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSPP15924 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSPP15924 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSPP15924 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSPP15924 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSPP15924 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSPP15924 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSPP15924 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSPP15924 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSPP15924 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSPP15924 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSPP15924 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSPP15924 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSPP15924 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSPP15924 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSPP15924 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSPP15924 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSPP15924 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSPP15924 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSPP15924 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSPP15924 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSPP15924 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSPP15924 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSPP15924 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DSPP15924 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSPP15924 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSPP15924 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSPP15924 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSPP15924 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSPP15924 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSPP15924 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSPP15924 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSPP15924 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSPP15924 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms