Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HSP90AB1P08238 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms