Protein–RNA interactions for Protein: P04279

SEMG1, Semenogelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMG1P04279 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMG1P04279 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms