Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SURF6O75683 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SURF6O75683 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SURF6O75683 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SURF6O75683 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SURF6O75683 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SURF6O75683 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SURF6O75683 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SURF6O75683 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SURF6O75683 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SURF6O75683 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SURF6O75683 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SURF6O75683 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SURF6O75683 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SURF6O75683 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SURF6O75683 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SURF6O75683 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SURF6O75683 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SURF6O75683 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SURF6O75683 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SURF6O75683 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SURF6O75683 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SURF6O75683 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SURF6O75683 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SURF6O75683 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SURF6O75683 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SURF6O75683 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SURF6O75683 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SURF6O75683 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SURF6O75683 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SURF6O75683 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SURF6O75683 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SURF6O75683 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SURF6O75683 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SURF6O75683 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SURF6O75683 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SURF6O75683 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SURF6O75683 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SURF6O75683 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SURF6O75683 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SURF6O75683 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SURF6O75683 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SURF6O75683 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SURF6O75683 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SURF6O75683 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SURF6O75683 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SURF6O75683 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SURF6O75683 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SURF6O75683 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SURF6O75683 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SURF6O75683 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SURF6O75683 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SURF6O75683 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SURF6O75683 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SURF6O75683 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SURF6O75683 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SURF6O75683 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SURF6O75683 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SURF6O75683 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SURF6O75683 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SURF6O75683 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SURF6O75683 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SURF6O75683 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SURF6O75683 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SURF6O75683 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SURF6O75683 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SURF6O75683 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SURF6O75683 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SURF6O75683 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SURF6O75683 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SURF6O75683 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SURF6O75683 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SURF6O75683 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SURF6O75683 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SURF6O75683 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SURF6O75683 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SURF6O75683 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SURF6O75683 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SURF6O75683 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SURF6O75683 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SURF6O75683 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SURF6O75683 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SURF6O75683 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SURF6O75683 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SURF6O75683 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SURF6O75683 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SURF6O75683 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SURF6O75683 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SURF6O75683 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SURF6O75683 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SURF6O75683 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SURF6O75683 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SURF6O75683 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SURF6O75683 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SURF6O75683 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SURF6O75683 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SURF6O75683 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SURF6O75683 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SURF6O75683 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SURF6O75683 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms