Protein–RNA interactions for Protein: A6NFN3

RBFOX3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX3A6NFN3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBFOX3A6NFN3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms