Protein–RNA interactions for Protein: A6NCQ9

RNF222, RING finger protein 222, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF222A6NCQ9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF222A6NCQ9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF222A6NCQ9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF222A6NCQ9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF222A6NCQ9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF222A6NCQ9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF222A6NCQ9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF222A6NCQ9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF222A6NCQ9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF222A6NCQ9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF222A6NCQ9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF222A6NCQ9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF222A6NCQ9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF222A6NCQ9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF222A6NCQ9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF222A6NCQ9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF222A6NCQ9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF222A6NCQ9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF222A6NCQ9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF222A6NCQ9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF222A6NCQ9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF222A6NCQ9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF222A6NCQ9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF222A6NCQ9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF222A6NCQ9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms