Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 AC113615.1-201ENST00000507424 4121 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 MKI67-202ENST00000368654 12678 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 PKP4-202ENST00000389759 4443 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 FTX-215ENST00000638681 9771 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 NCOA4-205ENST00000583565 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 CDH6-201ENST00000265071 8476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 PTPRB-209ENST00000550857 5839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 AP004607.6-201ENST00000525033 1202 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 ERG-203ENST00000398905 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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COL4A5P29400 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 ERC1-202ENST00000355446 5796 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 DGKB-206ENST00000407950 3651 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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