RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438735.1

CXCR6-202, Transcript of C-X-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene CXCR6, Length 2,242 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR6-202ENST00000438735 NISCHQ9Y2I1 1504 aa14.5□□□□□ -0.09
CXCR6-202ENST00000438735 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CXCR6-202ENST00000438735 HRCP23327 699 aa13.4□□□□□ -0.26
CXCR6-202ENST00000438735 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
CXCR6-202ENST00000438735 MYT1Q01538 1121 aa13.04□□□□□ -0.32
CXCR6-202ENST00000438735 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CXCR6-202ENST00000438735 PCGF6Q9BYE7 350 aa12.93□□□□□ -0.34
CXCR6-202ENST00000438735 MYO15BQ96JP2 1530 aa12.72□□□□□ -0.37
CXCR6-202ENST00000438735 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa12.54□□□□□ -0.4
CXCR6-202ENST00000438735 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
CXCR6-202ENST00000438735 NEUROD1Q13562 356 aa12.46□□□□□ -0.41
CXCR6-202ENST00000438735 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
CXCR6-202ENST00000438735 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa12.42□□□□□ -0.42
CXCR6-202ENST00000438735 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa12.38□□□□□ -0.43
CXCR6-202ENST00000438735 CHIC1Q5VXU3 224 aa12.38□□□□□ -0.43
CXCR6-202ENST00000438735 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa12.37□□□□□ -0.43
CXCR6-202ENST00000438735 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
CXCR6-202ENST00000438735 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
CXCR6-202ENST00000438735 BCL11AQ9H165 835 aa12.33□□□□□ -0.44
CXCR6-202ENST00000438735 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
CXCR6-202ENST00000438735 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
CXCR6-202ENST00000438735 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
CXCR6-202ENST00000438735 ABCC9O60706 1549 aa12.23□□□□□ -0.45
CXCR6-202ENST00000438735 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa12.21□□□□□ -0.46
CXCR6-202ENST00000438735 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CXCR6-202ENST00000438735 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
CXCR6-202ENST00000438735 DCAF8L2P0C7V8 631 aa12.17□□□□□ -0.46
CXCR6-202ENST00000438735 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
CXCR6-202ENST00000438735 ANP32EQ9BTT0 268 aa11.99□□□□□ -0.49
CXCR6-202ENST00000438735 CSRNP3Q8WYN3 585 aa11.94□□□□□ -0.5
CXCR6-202ENST00000438735 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
CXCR6-202ENST00000438735 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
CXCR6-202ENST00000438735 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa11.79□□□□□ -0.52
CXCR6-202ENST00000438735 TRIM41Q8WV44 630 aa11.78□□□□□ -0.52
CXCR6-202ENST00000438735 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
CXCR6-202ENST00000438735 ERICH6Q7L0X2 663 aa11.74□□□□□ -0.53
CXCR6-202ENST00000438735 NACADO15069 1562 aa11.72□□□□□ -0.53
CXCR6-202ENST00000438735 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa11.72□□□□□ -0.53
CXCR6-202ENST00000438735 APLP2Q06481 763 aa11.72□□□□□ -0.53
CXCR6-202ENST00000438735 MIER1Q8N108 512 aa11.7□□□□□ -0.54
CXCR6-202ENST00000438735 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
CXCR6-202ENST00000438735 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CXCR6-202ENST00000438735 SCRIBQ14160 1630 aa11.62□□□□□ -0.55
CXCR6-202ENST00000438735 UNC13AQ9UPW8 1703 aa11.59□□□□□ -0.55
CXCR6-202ENST00000438735 EHMT2Q96KQ7 1210 aa11.56□□□□□ -0.56
CXCR6-202ENST00000438735 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CXCR6-202ENST00000438735 CLSPNQ9HAW4 1339 aa11.5□□□□□ -0.57
CXCR6-202ENST00000438735 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP11.48□□□□□ -0.57
CXCR6-202ENST00000438735 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
CXCR6-202ENST00000438735 MSH5O43196 834 aa11.45□□□□□ -0.58
CXCR6-202ENST00000438735 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
CXCR6-202ENST00000438735 BICRAQ9NZM4 1560 aa11.43□□□□□ -0.58
CXCR6-202ENST00000438735 BCANQ96GW7 911 aa11.43□□□□□ -0.58
CXCR6-202ENST00000438735 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
CXCR6-202ENST00000438735 CCDC136Q96JN2 1154 aa11.34□□□□□ -0.59
CXCR6-202ENST00000438735 DEKP35659 375 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CXCR6-202ENST00000438735 CECR2Q9BXF3 1484 aa11.3□□□□□ -0.6
CXCR6-202ENST00000438735 FKBP8Q14318 412 aa11.29□□□□□ -0.6
CXCR6-202ENST00000438735 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa11.27□□□□□ -0.61
CXCR6-202ENST00000438735 ITGAEP38570 1179 aa11.26□□□□□ -0.61
CXCR6-202ENST00000438735 MROH2BQ7Z745 1585 aa11.25□□□□□ -0.61
CXCR6-202ENST00000438735 KCNH8Q96L42 1107 aa11.21□□□□□ -0.61
CXCR6-202ENST00000438735 FANCIQ9NVI1 1328 aa11.19□□□□□ -0.62
CXCR6-202ENST00000438735 WIZO95785 1651 aa11.19□□□□□ -0.62
CXCR6-202ENST00000438735 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CXCR6-202ENST00000438735 MYT1LQ9UL68 1186 aa11.17□□□□□ -0.62
CXCR6-202ENST00000438735 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CXCR6-202ENST00000438735 ERICH6BQ5W0A0 696 aa11.15□□□□□ -0.62
CXCR6-202ENST00000438735 IL27Q8NEV9 243 aa11.13□□□□□ -0.63
CXCR6-202ENST00000438735 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CXCR6-202ENST00000438735 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
CXCR6-202ENST00000438735 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
CXCR6-202ENST00000438735 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP11.09□□□□□ -0.63
CXCR6-202ENST00000438735 NBR1Q14596 966 aa11.09□□□□□ -0.63
CXCR6-202ENST00000438735 NEFLP07196 543 aa11.07□□□□□ -0.64
CXCR6-202ENST00000438735 SMARCA4P51532 1647 aa11.05□□□□□ -0.64
CXCR6-202ENST00000438735 DNAJC5BQ9UF47 199 aa11.05□□□□□ -0.64
CXCR6-202ENST00000438735 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
CXCR6-202ENST00000438735 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa11.03□□□□□ -0.64
CXCR6-202ENST00000438735 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
CXCR6-202ENST00000438735 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CXCR6-202ENST00000438735 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
CXCR6-202ENST00000438735 PKNOX2Q96KN3 472 aa11□□□□□ -0.65
CXCR6-202ENST00000438735 CCDC88BA6NC98 1476 aa11□□□□□ -0.65
CXCR6-202ENST00000438735 CEP162Q5TB80 1403 aa10.98□□□□□ -0.65
CXCR6-202ENST00000438735 TRIM52Q96A61 297 aa10.96□□□□□ -0.65
CXCR6-202ENST00000438735 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
CXCR6-202ENST00000438735 SMARCA2P51531 1590 aa10.95□□□□□ -0.66
CXCR6-202ENST00000438735 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
CXCR6-202ENST00000438735 PLEKHG5O94827 1062 aa10.94□□□□□ -0.66
CXCR6-202ENST00000438735 ABCC8Q09428 1581 aa10.94□□□□□ -0.66
CXCR6-202ENST00000438735 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa10.91□□□□□ -0.66
CXCR6-202ENST00000438735 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
CXCR6-202ENST00000438735 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
CXCR6-202ENST00000438735 PEG3Q9GZU2 1588 aa10.85□□□□□ -0.67
CXCR6-202ENST00000438735 SOGA1O94964 1423 aa10.85□□□□□ -0.67
CXCR6-202ENST00000438735 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
CXCR6-202ENST00000438735 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
CXCR6-202ENST00000438735 UBTFP17480 764 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
CXCR6-202ENST00000438735 EEA1Q15075 1411 aa10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.6 ms