Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
V9GYQ6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
V9GYQ6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
V9GYQ6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
V9GYQ6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
V9GYQ6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
V9GYQ6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
V9GYQ6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
V9GYQ6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
V9GYQ6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
V9GYQ6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
V9GYQ6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
V9GYQ6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
V9GYQ6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
V9GYQ6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
V9GYQ6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
V9GYQ6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
V9GYQ6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYQ6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYQ6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYQ6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYQ6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYQ6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYQ6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYQ6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYQ6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYQ6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYQ6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYQ6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYQ6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYQ6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYQ6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYQ6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYQ6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYQ6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYQ6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYQ6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYQ6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYQ6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYQ6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYQ6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYQ6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYQ6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYQ6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYQ6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYQ6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYQ6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYQ6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYQ6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYQ6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYQ6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYQ6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYQ6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYQ6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYQ6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYQ6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYQ6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYQ6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYQ6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYQ6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYQ6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYQ6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYQ6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYQ6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYQ6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYQ6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYQ6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYQ6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYQ6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYQ6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYQ6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYQ6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYQ6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYQ6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYQ6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYQ6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYQ6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYQ6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYQ6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYQ6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYQ6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYQ6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYQ6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYQ6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYQ6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYQ6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYQ6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYQ6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYQ6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYQ6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYQ6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYQ6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYQ6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYQ6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYQ6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYQ6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYQ6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms