Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCOA3Q9Y6Q9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms