Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA3Q9Y6H8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA3Q9Y6H8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA3Q9Y6H8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA3Q9Y6H8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA3Q9Y6H8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA3Q9Y6H8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA3Q9Y6H8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA3Q9Y6H8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA3Q9Y6H8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA3Q9Y6H8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA3Q9Y6H8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA3Q9Y6H8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA3Q9Y6H8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA3Q9Y6H8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA3Q9Y6H8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA3Q9Y6H8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA3Q9Y6H8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA3Q9Y6H8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJA3Q9Y6H8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJA3Q9Y6H8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJA3Q9Y6H8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJA3Q9Y6H8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJA3Q9Y6H8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJA3Q9Y6H8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms