Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

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Length 3,996 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HECTD4Q9Y4D8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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