Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
AMFRQ9UKV5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMFRQ9UKV5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms