Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NKIRAS2Q9NYR9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms