Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms