Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.587e-7■■■■■ 213.6
UTP3Q9NQZ2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.487e-7■■■■■ 213.6
UTP3Q9NQZ2 CTIF-203ENST00000587752 683 ntTSL 516.06■□□□□ 0.168e-8■■■■■ 213.4
UTP3Q9NQZ2 C11orf80-209ENST00000527368 812 ntTSL 524.28■■□□□ 1.481e-6■■■■■ 213.3
UTP3Q9NQZ2 C11orf80-202ENST00000524551 548 ntAPPRIS ALT2 TSL 521.1■□□□□ 0.971e-6■■■■■ 213.3
UTP3Q9NQZ2 C11orf80-211ENST00000531400 367 ntTSL 312.33□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 213.3
UTP3Q9NQZ2 MMS19-207ENST00000434538 2164 ntTSL 212.43□□□□□ -0.421e-13■■■■■ 213.2
UTP3Q9NQZ2 MMS19-204ENST00000415383 3401 ntTSL 1 (best)12.37□□□□□ -0.431e-13■■■■■ 213.2
UTP3Q9NQZ2 MMS19-201ENST00000327238 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.461e-13■■■■■ 213.2
UTP3Q9NQZ2 MMS19-203ENST00000370782 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.491e-13■■■■■ 213.2
UTP3Q9NQZ2 MMS19-209ENST00000438925 3797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.541e-13■■■■■ 213.2
UTP3Q9NQZ2 MMS19-202ENST00000355839 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.631e-13■■■■■ 213.2
UTP3Q9NQZ2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.481e-9■■■■■ 213.1
UTP3Q9NQZ2 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.311e-9■■■■■ 213.1
UTP3Q9NQZ2 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.031e-9■■■■■ 213.1
UTP3Q9NQZ2 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.031e-9■■■■■ 213.1
UTP3Q9NQZ2 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.12e-17■■■■■ 212.9
UTP3Q9NQZ2 VDAC3-206ENST00000521158 949 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.972e-17■■■■■ 212.9
UTP3Q9NQZ2 VDAC3-208ENST00000522010 631 ntTSL 57.02□□□□□ -1.292e-17■■■■■ 212.9
UTP3Q9NQZ2 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.352e-17■■■■■ 212.9
UTP3Q9NQZ2 WWOX-215ENST00000569332 1856 ntTSL 225.89■■□□□ 1.741e-9■■■■■ 212.7
UTP3Q9NQZ2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.981e-9■■■■■ 212.7
UTP3Q9NQZ2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.931e-9■■■■■ 212.7
UTP3Q9NQZ2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.841e-9■■■■■ 212.7
UTP3Q9NQZ2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.711e-9■■■■■ 212.7
UTP3Q9NQZ2 DLG5-201ENST00000372391 7415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 212.7
UTP3Q9NQZ2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.043e-14■■■■■ 212.6
UTP3Q9NQZ2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.843e-14■■■■■ 212.6
UTP3Q9NQZ2 CDK5RAP2-205ENST00000425647 2747 ntTSL 211.84□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 212.5
UTP3Q9NQZ2 CDK5RAP2-204ENST00000416449 3902 ntTSL 59.15□□□□□ -0.941e-6■■■■■ 212.5
UTP3Q9NQZ2 CSRNP1-202ENST00000514182 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 212.5
UTP3Q9NQZ2 TOP3B-215ENST00000470338 624 ntTSL 515.05■□□□□ -08e-7■■■■■ 212.4
UTP3Q9NQZ2 KCNAB2-211ENST00000445501 486 ntTSL 416.54■□□□□ 0.243e-8■■■■■ 212.4
UTP3Q9NQZ2 KCNAB2-216ENST00000478098 413 ntTSL 215.86■□□□□ 0.133e-8■■■■■ 212.4
UTP3Q9NQZ2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.491e-6■■■■■ 212.2
UTP3Q9NQZ2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.351e-6■■■■■ 212.2
UTP3Q9NQZ2 TBC1D22A-204ENST00000394449 2048 ntTSL 523.13■■□□□ 1.291e-6■■■■■ 212.2
UTP3Q9NQZ2 TBC1D22A-207ENST00000441162 2636 ntTSL 214.85□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 212.2
UTP3Q9NQZ2 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.012e-18■■■■■ 212.1
UTP3Q9NQZ2 DDX46-204ENST00000505592 555 ntTSL 27.55□□□□□ -1.22e-18■■■■■ 212.1
UTP3Q9NQZ2 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC16.31■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 212
UTP3Q9NQZ2 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.021e-10■■■■■ 211.8
UTP3Q9NQZ2 KIAA0141-202ENST00000432126 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.51e-10■■■■■ 211.8
UTP3Q9NQZ2 LDLRAP1-207ENST00000488127 4670 ntTSL 213.13□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 211.7
UTP3Q9NQZ2 WIPF3-201ENST00000242140 4184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.139e-10■■■■■ 211.6
UTP3Q9NQZ2 WIPF3-203ENST00000409290 4002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.899e-10■■■■■ 211.6
UTP3Q9NQZ2 PTK2-218ENST00000519993 4388 ntTSL 1 (best)19.77■□□□□ 0.761e-6■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.051e-6■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.141e-6■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.271e-6■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.195e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.945e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.895e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.745e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 SERINC5-204ENST00000512972 1627 ntTSL 225.48■■□□□ 1.675e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 SERINC5-206ENST00000632581 1573 ntTSL 225.45■■□□□ 1.665e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.645e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.595e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.435e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.385e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 HSD17B1-204ENST00000590299 1059 ntTSL 523.05■■□□□ 1.285e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.275e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.255e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 NT5C-202ENST00000577523 776 ntTSL 222.81■■□□□ 1.245e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.182e-6■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.135e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.135e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.115e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.085e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.075e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 TBC1D9B-209ENST00000519757 1208 ntTSL 221.6■■□□□ 1.055e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.045e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 EIF4ENIF1-208ENST00000423097 688 ntTSL 220.92■□□□□ 0.945e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 PIGQ-216ENST00000634341 1046 nt20.81■□□□□ 0.925e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.69■□□□□ 0.95e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 NFKBIL1-202ENST00000376146 1411 ntTSL 420.3■□□□□ 0.845e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.845e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.85e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF513-204ENST00000491924 566 ntTSL 519.9■□□□□ 0.785e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.765e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.765e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.745e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.665e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.575e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.555e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 KCNMA1-260ENST00000639483 4021 ntTSL 518.05■□□□□ 0.485e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 NDST1-202ENST00000518299 769 ntTSL 218.04■□□□□ 0.485e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 NT5C-212ENST00000582744 921 ntTSL 217.42■□□□□ 0.385e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.385e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.375e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.375e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.325e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 OBSCN-209ENST00000494839 583 ntTSL 217.01■□□□□ 0.315e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 CCNT2-206ENST00000446247 663 ntTSL 516.92■□□□□ 0.35e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.245e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 KCNMA1-274ENST00000639968 4126 ntTSL 516.51■□□□□ 0.235e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.225e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 RHBDD1-208ENST00000443477 371 ntTSL 416.34■□□□□ 0.215e-14■■■■■ 211.5
UTP3Q9NQZ2 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.175e-14■■■■■ 211.5
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 962 ms