Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLSTN2Q9H4D0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms