Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSBP4Q9BWG4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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