Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPIFA3Q9BQP9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms