Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOL4Q9BPW4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms