Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HACE1Q8IYU2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms