Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMUB2Q71RG4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMUB2Q71RG4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms