Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMEM259Q4ZIN3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM259Q4ZIN3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms