Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2B3Q16720 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
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