Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CHRNA2Q15822 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNA2Q15822 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms