Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPP1R1AQ13522 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPP1R1AQ13522 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 419.9 ms