Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE3BQ13370 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
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